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一文帶你了解qPCR原理與流程,建議收藏再看!
點擊次數(shù):353 更新時間:2024-11-12


實時熒光定量PCR

實時熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)是一種由PCR技術發(fā)展而來的分子生物學技術,它可以通過在DNA擴增過程中使用熒光染料來偵測每個PCR循環(huán)后產(chǎn)物的總量,具有PCR技術快速、靈敏的特點,同時還具有更高的特異性、實時監(jiān)測和可重復精確定量等優(yōu)勢。

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什么是qPCR?

1

qPCR化學原理-探針法

qPCR實驗流程包括RNA提取、逆轉錄和qPCR。

圖片

探針法qPCR原理圖,源自網(wǎng)絡,侵刪

qPCR探針法是一種使用熒光探針來測量PCR產(chǎn)物的技術。在PCR反應中,熒光探針會與PCR產(chǎn)物的特定序列結合,并發(fā)生熒光變化。隨著PCR反應的進行,PCR產(chǎn)物的數(shù)量增加,熒光探針與PCR產(chǎn)物結合的數(shù)量也會隨之增加。通過測量熒光信號的強度,可以確定PCR產(chǎn)物的數(shù)量。

2

qPCR化學原理-染料法

qPCR染料法是一種使用DNA結合染料來測量PCR產(chǎn)物的技術。在PCR反應中,DNA結合染料會與PCR產(chǎn)物的雙鏈DNA結合,從而發(fā)生熒光變化。隨著PCR反應的進行,PCR產(chǎn)物的數(shù)量增加,DNA結合染料的熒光信號也會隨之增加。通過測量熒光信號的強度,可以確定PCR產(chǎn)物的數(shù)量。

圖片

染料法qPCR原理圖,源自網(wǎng)絡,侵刪


圖片




RNA提取



樣本采集與保存

RNA提取的第一步是樣本采集和保存。對于細胞和組織樣本,需要在采集后盡快進行RNA提取,以避免RNA的降解。對于血液樣本,需要使用RNA穩(wěn)定劑或直接進行RNA提取。另外,樣本的保存溫度和時間也需要根據(jù)不同的實驗目的進行選擇。

樣本處理

樣本前處理是為了去除樣品中的細胞碎片、蛋白質、DNA等雜質,從而提高RNA的純度。常見的樣本前處理方法包括離心、過濾和洗滌等。

樣本裂解

樣本裂解是將細胞膜破壞,使RNA釋放到溶液中的過程。常見的樣本裂解方法包括機械裂解、化學裂解和熱裂解等。

提取純化

RNA提取后,需要進行純化并去除DNA、蛋白質和其他雜質。RNA純化試劑盒、硅膠柱和磁珠等方法都可以用于RNA提取后的純化。需要注意使用RNase-free試劑和器具,并在純化過程中避免RNA的降解。

質量檢測

RNA提取后,需要進行質量檢測以確保RNA的完整性和純度??梢允褂蒙锓治鰞x或瓊脂糖凝膠電泳等方法進行質量檢測。




逆轉錄



逆轉錄反應

逆轉錄反應是將RNA轉錄成cDNA的過程。將提取的RNA與逆轉錄酶、引物(如oligo(dT)或隨機引物)和dNTPs混合,在適宜的溫度下進行反轉錄反應,合成cDNA。

逆轉錄反應溫度和時間需要根據(jù)逆轉錄酶的不同而進行選擇。

cDNA純化

逆轉錄反應后,需要將cDNA純化并去除RNA、逆轉錄酶等雜質??梢允褂胏DNA純化試劑盒或磁珠等方法進行純化。




qPCR



引物設計

qPCR染料法的引物設計原則與其他PCR反應的引物設計原則基本相同,主要考慮以下因素:

(1)引物長度:通常為18-24個堿基對;

(2)引物Tm值:應當在55-65℃之間;

(3)引物特異性:應當避免與非目標序列的互補;

(4)引物末端修飾:可以增強引物的特異性和穩(wěn)定性。

內(nèi)參選擇

內(nèi)參是用于校正樣品間差異的參照基因。內(nèi)參應當具有以下特點:

(1)在不同樣品中表達穩(wěn)定;

(2)與目標基因同等易檢測;

(3)不會受到實驗條件的影響。

常見的內(nèi)參包括GAPDH、Actin、Tublin等。

模板用量

確定qPCR實驗中cDNA模板的稀釋度數(shù)需要進行預實驗來確定最佳的稀釋倍數(shù)。以下是一些步驟:

(1)準備一系列不同濃度的cDNA稀釋液,例如原液、1:10、1:100等;

(2)進行qPCR反應,并記錄Ct值;

(3)選擇Ct值在18-28范圍內(nèi)的稀釋倍數(shù)。

程序設置

在qPCR實驗中,程序設置通常包括以下步驟(具體參照說明書進行):

(1)預變性:95℃,5min;

(2)循環(huán)反應:95℃,30s;55℃,30s;72℃,30s;40個循環(huán)。

注:循環(huán)反應可分為兩步法和三步法。兩步法將常規(guī)PCR反應中的退火、延伸步驟進行合并,因此減少了反應步驟、縮短了反應時間。一般情況下,使用兩步法程序進行擴增即可滿足實驗需求。如果模板濃度低或qPCR擴增效率低時,可嘗試三步法反應程序。




02




好貨推薦

在分子生物學研究和臨床診斷領域,實時熒光定量PCR(qPCR)技術以其高靈敏度、高特異性和準確性而成為不·可·或·缺的工具。

今天,給大家推薦一款專為丁型肝炎病毒(HDV)RNA設計的qPCR檢測利器——RoboGene HDV RNA Quantification Kit 2.0。

圖片

RoboGene HDV RNA 定量試劑盒 2.0 旨在使用即時病毒 RNA/DNA 試劑盒對人 EDTA 血漿或血清樣本中的丁型肝炎病毒 (HDV) RNA 進行實時 PCR 定量。


特點


雙重試劑盒版本

提供兩種不同的試劑盒版本,一種是用于LightCycler® 480和7500 Fast實時PCR系統(tǒng)的0.1 ml(白色)低輪廓試紙條,另一種是用于Rotor-Gene™ 3000/6000/Q的0.2 ml(透明)常規(guī)試管。

高靈敏度和寬線性范圍

手動純化下的檢測限(LoD)為6 IU/ml,線性范圍從5至1x10^8 IU/ml,這表明試劑盒具有出色的靈敏度和寬泛的定量范圍。

廣泛的基因型覆蓋

能夠檢測1至8型HDV RNA,適用于全球不同地區(qū)流行的HDV基因型。



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